En el contexto de la estrategia de modernización de los Sistemas de Pagos del Banco Central de Reserva de El Salvador, a partir del 28 de enero de 2021 se migró a un nuevo proceso de Compensación de Cheques, el cual permite el intercambio de imágenes y datos entre instituciones participantes, utilizando estándares internacionales en materia de compensación, en el cual el procesamiento de los cheques a compensar se pueda realizar de una manera mucho más eficiente y segura, posibilitando acortar los tiempos de acreditación de fondos, lo que contribuye a una mayor circulación del dinero, beneficiando de esta forma a dinamizar la economía del país; asimismo, permite consolidar un sistema financiero moderno en materia de sistemas de pagos.
El nuevo proceso de compensación de cheques provee múltiples beneficios para las instituciones financieras participantes y principalmente para la población en general, entre los cuales se destacan los siguientes:
| Operador: | Banco Central de Reserva de El Salvador. |
| Participantes: | Instituciones autorizadas por la Superintendencia del Sistema Financiero para recibir depósitos a la vista retirables por medio de cheques u otros medios. |
| Normativa Relacionada: | Instructivo para la Administración y Operación de la Compensación de Cheques. Instructivo para la Estandarización del Cheque en el Sistema Financiero. |

| 1. Banco Agrícola, S.A. | 11. Banco Azul de El Salvador, S.A. |
| 2. Banco Davivienda, S.A. | 12. Citibank, N.A. Sucursal El Salvador |
| 3. Banco Hipotecario de El Salvador, S.A. | 13. Banco de Apoyo Integral, S.A. |
| 4. Banco Cuscatlán de El Salvador, S.A. | 14. Federación de Cajas de Crédito y de Bancos de los Trabajadores, Sociedad Coop. de R.L. de C.V. (FEDECREDITO) |
| 5. Banco de Fomento Agropecuario | 15. Sociedad de Ahorro y Crédito Multimoney, S. A. |
| 6. Banco Promerica El Salvador, S.A. | 16. Sociedad de Ahorro y Crédito Credicomer, S.A. |
| 7. Banco de América Central, S.A. | 17. BANCOVI de R.L. |
| 8. Banco Atlántida, S.A. | 18. ASOCIACION COOP. DE AHORRO Y CREDITO DEL COLEGIO MEDICO DE EL SALV. DE R.L. (COMEDICA) |
| 9. Banco Abank El Salvador, S.A. | |
| 10. Banco Industrial El Salvador, S.A. |